programming subsequence algorithm dynamic
A Long read hybrid error correction algorithm based on segmented pHMM
A Long read hybrid error correction algorithm based on segmented pHMM 2023/12/15 11:06:36 The "Long read hybrid error correction algorithm based on se ......
ASP.NET Core 6(.NET 6) Program.cs中使用读取appsettings.json配置文件
在ASP.NET Core 6 (.NET 6)中，可以使用Json格式的appsettings.json配置文件来配置应用程序，用于存储应用程序的配置信息，方便我们灵活的配置应用程序。本文主要介绍Program.cs中，使用读取appsettings.json配置文件的方法，以及相关的示例代码 ......
SV interface and Program3
时钟域的理解 在仿真过程中,时钟跳变的一瞬间,CPU将时间域划分为不同的时钟域执行不同的代码 信号在芯片中都是金属丝,在进行跳变的时候都是电容的充放电过程,通常使用时钟上升沿进行模拟,而不使用时钟下降沿 // define the interface interface mem_if(input w ......
CF1914F Programming Competition 贪心原则的DP?
终于理解了... 希望写给小伙伴们，希望大伙可以理解。 先确定贪心规则，即当最大子树不超过根子树减一的一半时，内部节点可以完全匹配。否则，可以先拿其他子树节点与最大子树内部节点匹配，子树内部再进行匹配。啥你说子树内部不够匹配怎么办？可以这么想，你这样都到匹配上限了，已经完全可以达到最优秀情况，取ma ......
SR Algorithm Analysis（1）——ZSSR
SR Algorithm Analysis（1）——ZSSR CVPR 2017 《“Zero-Shot” Super-Resolution using Deep Internal Learning》 目录SR Algorithm Analysis（1）——ZSSRInnovations：Backg ......
ISO C++17 does not allow dynamic exception specifications
错误描述 提示C++17不支持动态异常规格。 解决步骤： 1、安装低版本的g++及gcc（如g++-9及gcc-9） sudo apt-get install gcc-9sudo apt-get install g++-9 2、设置默认编辑器 sudo update-alternatives --i ......
PacBio long-read error correction algorithms
为了更深入了解纠错策略，以下是一些相关的研究论文，供您参考： 纠错策略的相关研究综述：该综述对国内外专家多年来关于错误和纠错相关理论的研究进行了总结和归纳。其中包括错误分析的相关研究（错误的定义、错误产生的原因、错误的类型）、纠错的相关研究（纠错的定义、纠错的意义、纠错策略、纠错时机）、国内外有关纠 ......
LocPatcH An efficient long-read hybrid error correction algorithm based on local pHMM
该文档主要介绍了一种基于装配的方法和概率隐藏马尔科夫模型 (pHMM) 用于纠正长读序列的错误。文档详细描述了对酵母数据进行实验的结果、纠正方法的拓扑结构以及实验设置和数据集。 这种基于装配的纠正方法相对于直接纠正存在哪些优势？ pHMM 的拓扑结构是怎样的？ 在实验中使用了什么样的数据集？ 提示： ......
long-read error correction algorithms”
“long-read error correction algorithms”是指用于纠正长读长测序数据中错误的算法。长读长测序技术能够产生更长的DNA或RNA序列，但也容易受到测序过程中的错误影响。这些算法通过分析测序数据中的错误模式和参考序列信息，识别和纠正错误，从而提高长读长测序数据的准确性和 ......
UNIQUE VISION Programming Contest 2023 Christmas (AtCoder Beginner Contest 334)
UNIQUE VISION Programming Contest 2023 Christmas (AtCoder Beginner Contest 334) A - Christmas Present 代码: #include <bits/stdc++.h> using namespace std ......
Bellman-Ford Algorithm 算法
一、处理问题：负权值有向图单原点最短路径问题 二、算法描述： 假设带权值有向图中没有包含负权值环。 定义一个距离数组，dist[0...n-1]，dis[i]表示从原点到i的最短路径值 初始化数组，假设一开始在原点src出发，终点为dst，那么dist[src] = 0 遍历所有的有向边，当前遍历边 ......
A Long read hybrid error correction algorithm based on segmented pHMM 基于pHMM的DNA序列分析与错误修正方法研究
基于pHMM的DNA序列分析与错误修正方法研究 这篇论文主要内容是关于DNA序列分析中的错误纠正方法。论文提出了一种基于概率隐马尔可夫模型(pHMM)的错误纠正方法。首先，通过SR-LR对齐和基于短读序列对齐的预处理步骤，对DNA序列进行处理。然后，利用pHMM构建了一个隐藏的马尔可夫模型，并进行前 ......
Q:以非root用户编辑定时任务报错You are not allowed to use this program(crontab)
编辑定时删除文件任务时报错 crontab -e 编辑定时任务时报错，如下图所示 问题原因：/etc/cron.allow中没有添加对应的用户名解决办法：切换到root用户，在/etc/cron.allow中添加对应的用户名 编辑定时任务：crontab -e #每天中午13点，定时删除/var路径 ......
CF1621G Weighted Increasing Subsequences
CF1621G Weighted Increasing Subsequences 你有一个长度为 \(n\) 的序列，定义 \(a\) 的一个长度为 \(k\) 的子序列为 \(a_{i_1},a_{i_2},\dots,a_{i_k}\)。由此，我们不难发现，\(a\) 的一个长度为 \(k\) ......
关于Secure Hash Algorithm加密算法
一、概述 SHA（Secure Hash Algorithm）加密算法是一种广泛应用的密码散列函数，由美国国家安全局（NSA）设计，用于保障数据的安全性和完整性。SHA算法经历了多个版本的更新，目前主要应用于各种网络安全和数据加密领域。 SHA在线加密 | 一个覆盖广泛主题工具的高效在线平台(amd ......
How to Master the Popular DBSCAN Clustering Algorithm for Machine Learning
Overview DBSCAN clustering is an underrated yet super useful clustering algorithm for unsupervised learning problems Learn how DBSCAN clustering works ......
[Codeforces] CF1817A Almost Increasing Subsequence
CF1817A Almost Increasing Subsequence 题意 给定长度为 \(n\) 一个序列 \(a\) 以及 \(q\) 次询问，每次询问给出 \(l\) 和 \(r\)，找出序列 \(a\) 在 \([l,r]\) 内最长的几乎递增子序列。 对于几乎递增的定义：如果一个序列 ......
（15-418）Lecture 4 Parallel Programming Basics
并行编程的步骤 可以把并行编程分为下图中的四个步骤： Decmposition 把问题分解为能够并行化的任务，Amdahl定律指出，程序的串行部分制约着并行程序的加速比。 要将一张照片的每个象素的亮度翻倍、计算所有象素的平均值，由于这两部分都是可并行化的，所以加速比可以接近理想情况： Assignm ......
TensorIR: An Abstraction for Automatic Tensorized Program Optimization
Abstract 在多种多样的设备上部署深度学习模型是一个重要的话题，专用硬件的蓬勃发展引入了一系列加速原语和多维张量计算方法。这些新的加速原语和不断出现的新的机器学习模型，带来了工程上的巨大挑战。本文提出了TensorIR，是为了优化这些有张量计算原语的张量化程序而设计的编译器抽象。TensorI ......
[Ynoi2007]rfplca/[CF1491H] Yuezheng Ling and Dynamic Tree
题目描述 给定一棵大小为 \(n\) 的 \(1\) 为根节点的树，树用如下方式给出：输入 \(a_2,a_3,\dots,a_n\)，保证 \(1\leq a_i<i\)，将 \(a_i\) 与 \(i\) 连边形成一棵树。 接下来有 \(m\) 次操作，操作有两种： 1 l r x 令 \(a_ ......
An Introduction to Bioinformatics Algorithms, Neil C. Jones and Pavel Pevzner, the MIT Press, 2004.
An Introduction to Bioinformatics Algorithms, Neil C. Jones and Pavel Pevzner, the MIT Press, 2004. This introductory text offers a clear exposition o ......
CF1914F Programming Competition
原题链接 感觉有点类似 agc034e Complete Compress，但那题比这个难得多。 定义 \(f_x\) 为以 \(x\) 为根的子树中，尽可能组队后最多剩下多少人，\(siz_x\) 为子树大小。 记 \(y\in son(x)\) 中 \(f_y\) 最大的点为 \(hson_x\ ......
Feedback Control of Dynamic Systems_P2
187. Problems for Section 5.4: Design Using Dynamic Compensation 5.21 Let \[G(s) = \frac{1}{s^{2} + 7s + 12}\ \text{~}\text{and}\text{~}\ D_{c}(s) = K ......
Feedback Control of Dynamic Systems_P1
GLOBAL EDITION 1. Feedback Control of Dynamic Systems EIGHTH EDITION Franklin \(\cdot\) Powell \(・\) Emami-Naeini Table of Laplace Transforms Number \ ......
Programming Abstractions in C阅读笔记：p235-p241
《Programming Abstractions in C》学习第66天，p235-p241总结。 一、技术总结 1.backtracking algorithm(回溯算法) (1)定义 p236, For many real-world problem, the solution process ......
BIgdataAIML-IBM-A neural networks deep dive - An introduction to neural networks and their programming
https://developer.ibm.com/articles/cc-cognitive-neural-networks-deep-dive/ By M. Tim Jones, Published July 23, 2017 Neural networks have been around f ......
BigdataAIML-ML-Models for machine learning Explore the ideas behind machine learning models and some key algorithms used for each
最好的机器学习教程系列：https://developer.ibm.com/articles/cc-models-machine-learning/ By M. Tim Jones, Published December 4, 2017 Models for machine learning Alg ......
（15-418）Lecture 3 Parallel Programming Abstractions
抽象VS实现 实例：ISPC程序 ISPC是一种SPMD（single program multiple data）编译器。 利用ISPC编写的计算sin(x)的程序如下图： ISPC提供了一种抽象，当调用ISPC函数时（即程序中调用sinx的语句），会产生一个gang，这个gang含有多个ISPC ......
数据结构与算法 第二章线性表（48课时课程笔记）Data Structure and Algorithms
2.1 线性表的类型定义 一个线性表是n个数据元素的有限序列。 （1）结构初始化 InitList(&L) 构造一个空的线性表L。 （2）销毁结构 DestroyList(&L) （3）引用型操作 （4） 修改型操作 一个算法举例： 假设有两个集合A和B分别用两个线性表LA和LB表示（即：线性表中的 ......
2023 China Collegiate Programming Contest (CCPC) Guilin Onsite (The 2nd Universal Cup. Stage 8: Guilin)
题解： https://files.cnblogs.com/files/clrs97/2023Guilin_Tutorial.pdf Code： A. Easy Diameter Problem #include<bits/stdc++.h> using namespace std; const i ......